现为中国社会科学院考古研究所研究员，中国社会科学院大学教授，博士生导师，首都师范大学兼职硕士生导师，国家社科基金同行评议专家。主要研究方向为科技考古、植物考古和环境考古。主持国家重点研发计划“文化科技与现代服务业”重点专项“中国北方旱作农业起源、形成与发展研究（一期）”项目，国家社科基金重大项目《中国考古学百年史》（1921-2021）子课题，主持过多项国家级和省部级课题，作为骨干参加中华文明探源研究（一至五），著有《木材考古学：理论、方法和实践》一书，发表研究论文百余篇，多次获得省部级奖项。
建立了柴达木盆地东缘可追溯到公元前1575的长年表，此年表已经追溯到了夏末商初，曾是我国建立的最长的古木年轮年表，为青海省古文化的研究树立了年代标尺。利用所建的年表，对分布在柴达木盆地东缘的墓葬进行了定年，从所建年表中，提取了降水信息，对气候和古代文化之间的关系进行了探讨。对多个遗址的木材、木炭进行研究，获得了古代人类利用木材的信息，重建了遗址周边的微环境，弥补了历史文献的不足，为现今木材的合理选择和利用提供了弥足珍贵的史料。除了以上的学术研究外，还对考古遗址出土的植物遗存进行鉴定和分析，取得了一些重大的研究成果。从木材考古研究对象、研究理论、研究方法、研究内容和研究目的以及与其他学科的关系出发，提出了木材考古学的概念。现制作和收藏了千余种现代木材切片和500余种古代木材切片和1300余种现代切片，为考古出土植物样品的鉴定提供了比对样本。重视人才培养、队伍建设和国际合作，为考古机构和大学培养了20余名木材考古学研究人员，与英国利物浦大学考古系、西班牙洛维拉维吉利大学古人文生态学、立陶宛历史研究所维尔纽斯大学生物考古学系与社会进化学研究所、哈佛大学人类学系及日本民俗博物馆教授和科研人员合作做考古遗址的木材样品，召开学术研讨会和共同发表学术成果。
成果：
1、王树芝、赵一凡、王永磊、王海燕、焦延静：《施岙遗址良渚文化时期杨梅古树遗存的研究》，《考古》（已接受）。
2、王海燕、王树芝（通讯作者）、刘国祥、贾笑冰、孙永刚、胡春柏、焦延静：《辽西地区红山文化时期林木资源利用和生态环境研究》，《第四纪研究》2024年第44卷第1期，第100~111页。
3、Xuefang Zheng, Fei Peng, Shuzhi Wang（通讯作者）, Jialong Guo, Huiming Wang, Xing Gao, Zhijun Zhao. Plant exploitation and subsistence patterns of the Mesolithic in arid China: New evidence of plant macro-remains from the Pigeon Mountain site. Front. Earth Sci.,2023,11.https://doi.org/10.3389/feart.2023.1134677
4、刘晓迪、胡耀武、王树芝、杨益民、任萌、付永旭：《广西大岩和顶蛳山遗址陶器残留物分析及相关问题》，《考古》2023年第7期，第104~120页。
5、Xiaodi Liu , Meng Ren , Yongxu Fu , Yaowu Hu , Shuzhi Wang，Yimin Yang, New insights into the use of Neolithic pottery in Guangxi of South China: organic residue analysis of experimental and archaeological pottery, Heritage Science，2023.11:201https://doi.org/10.1186/s40494-023-01045-9
6、程雪寒、王树芝：《欧洲的树轮考古学》，见中国社会科学院考古研究所科技考古中心《科技考古》第七辑，科学出版社，2023年。
7、张启、程雪寒、王树芝：北京西山老龄树记载的森林干扰历史，《植物生态学报》DOI: 10.17521/cjpe.2023.0173
8、王树芝、丛德新：《青铜时代早期新疆温泉阿敦乔鲁遗址木材指示的环境和先民木材利用策略》，《第四纪研究》2022年第42卷第6期，第1723 ~1736页。
9、王树芝：《中国核桃的历史渊源、文化及发展》，《农业考古》2022年第6期，第14~23页。
10、程雪寒、王树芝（通讯作者）、朱岩石：《丝绸之路青海道吐蕃时期墓葬出土木材记载的森林干扰史》，《第四纪研究》2022年第42卷第1期，第192 ~ 205页。
11、崔红庆、王树芝（通讯作者）、张小虎、金和天、焦延静、夏正楷：《青海民和官亭盆地青铜时代遗址木炭遗存指示的生态环境与木材利用》，《第四纪研究》2022年第42卷第1期，第158 ~ 171页。
12、王树芝：《木材考古学概述——写在北大考古100周年之际》，北京大学考古文博学院、北京大学中国考古学研究中心：《考古学研究（十三）》北京：科学出版社，2022年4月，第620~655页。
13、王树芝、李冀源、郑雪芳、石晶：《青海都兰县哇沿水库坝址2014年发掘墓葬出土木材分析与树轮定年》，见文化遗产研究与保护技术教育部重点实验室、西北大学丝绸之路文化遗产保护与考古学研究中心、边疆考古与中国文化认同协同创新中心、西北大学唐仲英文化遗产研究与保护技术实验室：《西部考古》（第22辑），科学出版社，2022年5月，第241 ~ 251页。
14、王树芝、王增林、朱延平：《内蒙古喀喇沁旗大山前第I地点出土木炭分析与研究》，见国家文物局合组：（中国社会科学院考古研究所、内蒙古自治区文物考古研究所、吉林大学边疆考古研究中心）赤峰考古队编著：《大山前第I、II地点发掘报告》，故宫出版社，2022年10月，第782~791页。
15、王树芝著：《木材考古学：理论、方法和实践》，科学出版社，2021年10月，第1~483页。
16、王树芝、孙凯、焦延静：《鲁山望城岗冶铁遗址出土燃料鉴定与研究》，《华夏考古》，2021年第1期，第82~87页。
17、Xin Jia, Shuzhi Wang（通讯作者）, Yonggang Sun, Yiyin Li, Yanjing Jiao, Zhijun Zhao, Harry F Lee. 2021. Charcoal evidence for environmental change ca. 3.5 ka and its influence on ancient people in the West Liao River Basin of northeastern China. Quaternary Research. 102, 142–152. https://doi.org/10.1017/qua.2020.120
18、王树芝、邵雪梅、许新国、肖永民：《跨度为2332年的考古树轮年表的建立与夏塔图墓葬定年》，见中国社会科学院考古研究所、青海省文物考古研究所：《热水考古四十年》，科学出版社，2021年10月，578~586页
19、王树芝：《青海都兰地区公元前515年以来树木年轮年表的建立及应用》，见中国社会科学院考古研究所、青海省文物考古研究所：《热水考古四十年》，科学出版社，2021年10月，587~596页。
20、王树芝：《近年木材和木炭分析综述》，见中国社会科学院考古研究所科技考古中心《科技考古》第六辑，科学出版社，2021年10月，第30~43页。
21、Shuzhi Wang, Haitao Zhao, Guoliang Chen, Hong Xu, Marvin Demicoli. Anthracological analysis from the Bronze Age site of Erlitou (Henan province, China)，Quaternary International,2021, 593-594: 248-255.
22、王树芝、焦延静、冯丹：《凤翔雍山血池祭祀遗址出土木材鉴定与相关问题》，《考古与文物》2020年第6期，104~108页。
